Buscando desesperadamente el texto completo

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Una de las cosas más frustrantes que te suceden cuando has estado un buen rato haciendo una búsqueda bibliográfica para tu proyecto de investigación, o para tu TFG, o tu TFM, o para resolver una duda de la práctica habitual, es encontrar el artículo que crees que será imprescindible y no poder leerlo porque no tienes el pdf del texto completo. Frustrante, no?… pues en este post veremos varias herramientas que son importantes que conozcas, y utilices, cuando tengas que empezar a leer todas las referencias que has guardado en tu gestor de referencias bibliográficas….por que utilizas un gestor, no? Continue reading

4 errores frecuentes con los descriptores MeSH en Pubmed

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Cuando queremos buscar en Pubmed para una consulta sensible y rigurosa tenemos la opción de utilizar un lenguaje artificial, un tesauro, que está formado por un vocabulario controlado. El lenguaje artificial más utilizado es el que utiliza Medline; se llama “MeSH” y no siempre son evidentes, como vemos en estos  ejemplos:

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No siempre es fácil identificar los descriptores MeSH que corresponden al concepto que quiero buscar y esto facilita que hagamos muchos errores. A continuación recogemos los 4 errores más frecuentes:

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Bases de datos de referencias bibliográficas en castellano

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La búsqueda bibliográfica en bases de datos de referencias bibliográficas en ciencias de la salud publicadas en castellano nos permite identificar artículos publicados en castellano en revistas españolas, de América Latina y Caribe que posiblemente no encontrarías en bases de datos más internacionales, como Medline o Embase. Son herramientas indispensables si tu búsqueda tiene que ser muy exhaustiva o si tu inglés es una limitación importante.

Hemos seleccionado las principales bases de datos de referencias bibliográficas en ciencias de la salud en español y de acceso gratuito. Hay muchas más, algunas que requieren suscripción individual o institucional y otras que no parecen aportar mucho más a las que vamos a comentar.  Continue reading

Literatura gris

Literatura gris es toda aquella documentación (digital o impresa) que no ha sido publicada por las vías comerciales habituales (revistas indexadas, libros,…).

Incluye gran cantidad de formatos diferentes, entre ellos: tesis y tesinas, informes, actas y resúmenes de congresos, listas de distribución, foros, boletines, blogs, reportes técnicos, guías de práctica clínica, revisiones sistemáticas, proyectos de ensayos clínicos, resúmenes y revisiones críticas, evaluaciones, documentos de trabajo, ponencias, blogs, redes sociales, investigación no independiente,…

Esta literatura gris está elaborada por agentes muy diversos, como las agencias gubernamentales, agencias no gubernamentales, instituciones académicas, empresas, sociedades científicas, profesionales sanitarios, investigadores,…grey literature

Otra característica determinante de la literatura gris es su difícil identificación ya que suele estar en sitios de internet que no son accesibles a los buscadores habituales, como Google. Este espacio de internet se denomina la web profunda, oculta o invisible y es inmensamente más grande, como unas 500 veces más grande que el internet que utilizamos a diario.

En lugar de competir con la literatura publicada, la literatura gris tiene el potencial de complementar y comunicar los resultados a una mayor audiencia, así como reducir el sesgo de publicación. En la elaboración de una revisión sistemática es importante tener en cuenta a la literatura gris; se ha observado que esta es más propensa a incluir estudios de intervención con resultados no significativos que en las revistas científicas comercializadas. La ausencia de búsqueda en la literatura gris puede conducir a una sobreestimación del impacto de la revisión.

La literatura gris supone un reto para el profesional sanitario ya que no disponemos de unas fuentes concretas y limitadas donde poder hacer la búsqueda, sino que esta literatura se esconde en infinitas bases de datos, portales, repositorios, bibliotecas,…que dificulta enormemente su búsqueda e identificación. Hemos preparado una recopilación limitada de las principales fuentes que deberíamos consultar para hacer una búsqueda bibliográfica orientada a la identificación de literatura gris sobre salud, muy aconsejable si lo que pretendemos es tener una visión àmplia y no sesgada de las evidencias existentes sobre un determinado problema de salud.

 

 

Buscadores de literatura gris:

MedNar > Metabuscador que en tiempo real busca en multitud de bases de datos sobre salud con acceso a la web profunda.

Open Grey > Portal europeo de la literatura gris sobre ciencia, tecnología, biomedicina, economía, ciencias sociales y humanidades. Incluye informes técnicos y de investigación, tesis doctorales, ponencias y publicaciones oficiales.

Grey Literature Report > Publicación bimensual elaborado por The New York Academy of Medicine sobre literatura gris en el campo de la salud pública.

WorldWideScience.org > Cooperación internacional para integrar en un mismo buscador gran cantidad de bases de datos y portales relacionados con la ciencia.

OAIster > La Universidad de Michigan ha reunido millones de registros de más de 405 instituciones en la Web invisible.

The Virginia Henderson Global Nursing e-Respository > Servicio digital global que recoge, conserva y comparte investigación de enfermería y materiales de práctica basada en la evidencia.

 

Actas y resúmenes de congresos:

Pubmed > En la estrategia de búsqueda añade el tipo de estudio, “Article types” específico para identificar estudios presentados en congresos, p.ej.

…AND (Lectures[ptyp] OR Clinical Conference[ptyp] OR Congresses[ptyp] OR Consensus Development Conference[ptyp] OR Consensus Development Conference, NIH[ptyp])

 

Guías de Práctica Clínica:

TripDatabase > Metabuscador de primera elección. Proporciona acceso fácil a GPC elaboradas por diferentes entidades de todo el mundo.

Guidelines International Network (G-I-N) (+ info) > La red internacional de GPC posee la International Guideline Library. Posiblemente es la base de GPC más extensa e internacional del mundo.

Pubmed /Medline > Utilizando los filtros adecuados, podemos identificar específicamente GPC:...AND Practice Guideline[ptyp]

BuscaGuías > Motor de búsqueda personalizado realizado mediante las herramientas de búsqueda de Google.

PediaClic > Uno de los buscadores que incluye identifica exclusivamente GPC en español.

GuíaSalud > Imprescindible. GPC elaboradas en el Sistema Nacional de Salud español que han superado unos criterios de calidad específicos.

National Guideline Clearinghouse > Elaborada por la Agency for Health Research and Quality (AHRQ) en colaboración con la American Medical Association (AMA) y la America’s Health Insurance Plans que proporciona acceso a resúmenes de GPC de todo el mundo y a otros materiales relacionados.

NICE – National Institute for Health and Clinical Excellence > GPC elaboradas por el NICE, organismo del NHS de Reino Unido en Gales e Inglaterra.

SIGN – Scottish Clinical Gidelines > GPC elaboradas por el Scottish Intercollegiate Guidelines Network (SIGN) para el NHS de Reino Unido en Escocia.

New Zealand Guidelines Group > GPC y documentos elaboradas por el New Zealand Health System.

RNAO (Registered Nurses’ Association of Ontario) > Asociación profesional de enfermeras de Ontario (Canadá). Desde 2011, el  Centro Colaborador Español del Instituto Joanna Briggs, está traduciendo al español las “Guías de Buenas Prácticas en Enfermería” de la RNAO con acceso gratuito al texto completo de las guías.

 

Ensayos Clínicos en marcha:

ICTRP > WHO International Clinical Trials Registry Platform  

ISRCTN registry > reconocido por la OMS y el ICMJE

clinicaltrials.gov > base de datos de ensayos clínicos de todo el mundo

UKCTG > UK Clinical Trials Gateway

REec > Registro español de estudios clínicos

 

Tesis Doctorales

OATD > Open Access Theses and Dissertations: Con 3 millones de tesis y tesinas de más de 1000 universidades y centros de investigación de todo el mundo accesibles a texto completo.

DART  Europe > Asociación de bibliotecas europeas para facilitar el acceso a los investigadores a textos completos de tesis doctorales y tesinas digitalizadas de 583 universidades europeas de 28 países.

PQDT > Global ProQuest Dissertations & Theses Global. Con casi 4 millones de tesis y tesinas de 88 países con gran preponderancia hacia EUA y Reino Unido. Requiere subscripción de pago pero disponemos de la versión “free” en PQDT Open, con los autores de las tesis que decidieron publicar en abierto.

Teseo – España (MSC). Permite buscar las fichas de la tesis doctorales leídas en España según el registro oficial del Ministerio de Educación. Acceso al listado de tesis doctorales (título y abstract) registradas por el ministerio de sanidad y consumo de España.

TDR > Tesis doctorales en Red. Casi 60000 tesis consultables, de las cuales, 20000 a texto completo. La mayoría de universidades catalanas.

 

Motores de búsqueda personalizados:

Estos motores identifican fichas técnicas de medicamentos, informes de evaluación, guías, protocolos, alertas de seguridad, CATs, prospectos, síntesis, sinopsis, sumarios, resúmenes, respuestas a preguntas clínicas, información para pacientes, boletines, newsletters, blogs,..

Información farmacoterapéutica de Ernesto Barrera

Alquimia de Fernando do Pazo

Sobre Fármacos…de Carlos Almendro Padilla

Servicio de farmacia de Hospital General La Mancha Centro

Proyecto PediaClic. Resúmenes basados en la evidencia

Salud en Red del Proyecto Somos Medicina

El Metabuscador de Información Sanitaria de Miguel Molina

 

Bibliografía

The Joanna Briggs Institute Reviewers’ Manual 2015. The systematic review of studies of diagnostic test accuracy https://t.co/rmozjDhTEN

Finding the hard to finds: searching for grey literature (2012 update). Dean Giustini, UBC Biomedical Librarian. Enlace

Grey Matters! Finding Grey Literature. Sarah McGill, BSc, MLIS and Amanda Hodgson, MLIS. March 12, 2010. CADTH & ACMTS. Enlace

Grey Matters: a practical tool for searching health-related grey literature. CADTH Information Services. November 2015. Enlace

Grey Literature for Health Sciences: Getting Started. University of British Columbia Library. Enlace

Haddaway NR, Collins AM, Coughlin D, Kirk S (2015) The Role of Google Scholar in Evidence Reviews and Its Applicability to Grey Literature Searching. PLoS ONE 10(9): e0138237. doi:10.1371/journal.pone.0138237

Iñesta García A. Webs y buscadores en Ciencias de la Salud [Internet]. 2º edición. Madrid: Escuela Nacional de Sanidad – Instituto de Salud Carlos III; 2012 [consultado 20/12/2015]. Disponible en: enlace

Hopewell S1, McDonald S, Clarke M, Egger M. Grey literature in meta-analyses of randomized trials of health care interventions. Cochrane Database Syst. Rev. 2007 Apr 18;(2):MR000010. Enlace

HLWIKI International. Grey Lieterature. Enlace

Tyndall J. Health librarians and grey literature: what do we need to know? Presented Royal Melbourne Hospital, July 15 2014 and Royal Adelaide Hospital, September 25 2014. Enlace

Databases for Research in Health. Jess Tyndall, Medical Librarian; Catherine Brady, Reference Librarian. Flinders University Library January 2014. Enlace

 

Xavier Basurto (xbasurto@girtual.com)

www.girtual.com

Twitter: @girtual

 

 

Búsqueda bibliográfica y fuentes de consulta para farmacéuticos

Aprovechando que estamos realizando un curso sobre búsqueda bibliográfica para los farmacéuticos del Colegio de Farmacéuticos de Girona hemos elaborado un documento que recoge las principales fuentes de conocimiento, con sus enlaces web, especialmente destinado a los profesionales que trabajan en las oficinas de farmacia.

Más allá de las fuentes clásicas como Trip Database, Guiasalud, DARE, Cochrane, revistas secundarias y las bases primarias (Pubmed y CENTRAL), destacamos la búsqueda utilizando buscadores personalizados diseñados para identificar evidencias filtradas sobre medicamentos y también las fuentes de consulta que dan respuesta a las dudas básicas que los profesionales sanitarios y/o la población general podemos tener sobre un problema de salud concreto..

Aquí tienes el enlace al documento en pdf.

Si tienes sugerencias sobre otras fuentes que no hemos comentado en el documento, envíanos un mensaje vía Twitter a @girtual.

Búsqueda Bibliográfica Eficiente

Para hacer una búsqueda bibliográfica no es suficiente saber qué herramientas utilizar y cómo. Tenemos que seguir una secuencia jerarquizada de acciones que nos conduzca a una búsqueda más eficiente, sistemática y reproducible.

En esta infografía hemos intentado reproducir este método en 7 pasos básicos, destacando los pasos inciales y los finales, frecuentemente obviados: el paso 1 y 2 de preparación, en los que formulamos la pregunta PICO o PACO y creamos una tabla con los términos de búsqueda, y el paso nº7, en el que pedimos ayuda especialiada al bibliotecario/a o documentalista de nuestro centro.
En estos enlaces tienes la infografía en formato imagen jpg o en pdf.

 

Buscando tesis doctorales

En este post intentamos resumir la gran cantidad de herramientas disponibles para buscar tesis doctorales digitalizadas identificando a 5 de ellas que cubren Europa y Estados Unidos y son de acceso gratuito.


OATD – Open Access Theses and Dissertations:http://oatd.org/
Con casi 3 millones de tesis y tesinas de más de 1000 universidades y centros de investigación de todo el mundo accesibles a texto completo.

DART – Europe: http://www.dart-europe.eu/basic-search.php. Asociación de bibliotecas europeas para facilitar el acceseo a los investigadores a textos completos de tesis doctorales y tesinas digitalizadas de 583 universidades europeas de 28 países.

PQDT Globa ProQuest Dissertations & Theses Global: Con casi 4 millones de tesis y tesinas de 88 paises con gran preponderancia hacia EUA y Reino Unido. Requiere subscripción de pago pero disponemos de la versión “free” en PQDT Open, con los autores de las tesis que decidieron publicar en abierto.

Teseo – España (MSC): https://www.educacion.gob.es/teseo/irGestionarConsulta.do. Permite buscar las fichas de la tesis doctorales leídas en España según el registro oficial del Ministerio de Educación. Acceso al listado de tesis doctorales (título y abstract) registradas por el ministerio de sanidad y consumo de España.

TDR-Tesis doctorales en Red: http://www.tdx.cat/

Casi 60000 tesis consultables, de las cuales, 20000 a texto completo. La mayoría de universidades catalanas.

Buscando Revisiones Sistemáticas

Este es un resumen de las principales fuentes o herramientas que podemos utilizar si pretendemos identificar revisiones sistemáticas, existentes o en fase de protocolo, sobre temas relacionados con la atención sanitaria.

Epistemonikos
El metabuscador que tiene como objetivo único y específico identificar de manera rápida revisiones sistemáticas relacionadas con la salud. Identifica revisiones sistemáticas, revisiones panorámicas y los estudios primarios utilizados en las revisiones.
Trip Database
Un clásico. Un metabuscador clínico diseñado para encontrar de manera rápida y fácil la mejor evidencia procedente de la investigación. Una vez realizada la búsqueda, las referencias encontradas se clasifican según nivel de evidencia; seleccionamos el filtro de revisiones sistemáticas.
ACCESSSS

http://plus.mcmaster.ca/ACCESSSS/Default.aspx?Page=1

Es un metabuscador creado en la universidad de McMaster y diseñado para dar respuesta a dudas clínicas buscando las mejores evidencias en publicaciones médicas que utilizan criterios de medicina basada en la evidencia. Nos podemos registrar gratuitamente y utilizar su buscador, que nos ofrece los resultados clasificados jerárquicamente siguiendo la pirámide 6S; para identificar las revisiones sistemáticas clicamos en “Syntheses”.
Pubmed
Con la herramienta PubMed Clinical Queries podemos hacer una búsqueda simple para identificar las revisiones sistemáticas de Pubmed. Otra opción es utilizar el buscador general de Pubmed y con las referencias identificadas aplicar filtros por tipo de articulo (Review, Systematic Reviews, Meta-Analysis).
Pubmed Health
Complementario a la búsqueda en Pubmed disponemos de esta herramienta que tiene como objetivo reunir en un mismo sitio revisiones sistemáticas de ensayos clínicos sobre la efectividad de medidas de prevención, tratamientos y pruebas diagnósticas identificadas en Pubmed y simultáneamente en muchas otras fuentes (AHRQ, CC, DARE, NICE,…).
The Cochrane Library
Elaboran y difunden revisiones sistemáticas relacionadas con la atención sanitaria y publicadas en la Cochrane Database of Systematic Reviews. Podemos hacer también la búsqueda en español con acceso a los resúmenes de todas las revisiones en español y al texto original en inglés en La Biblioteca Cochrane Plus
The Campbell Library
Elaboran y difunden revisiones sistemáticas relacionadas con la educación, la delincuencia y la justicia, el bienestar social y el desarrollo internacional.
The EPPI-Centre
Elaboran y difunden revisiones sistemáticas relacionadas sobre educación, promoción de la salud, salud pública y el desarrollo internacional.
Joanna Briggs Institute
En el JBI Database of Systematic Reviews and Implementation Reports es la revista donde se publican las revisiones y los protocolos elaborados por el IJB y sus grupos y centros colaboradores internacionales sobre temas relacionados con la práctica basada en la evidencia, especialmente en el ámbito de los cuidados.
PROSPERO
Es un registro internacional prospectivo de revisiones sistemáticas. En esta base de datos encontrarás proyectos de revisión sistemática que se están llevando a cabo en todo el mundo, con los datos más importantes previstos de cada revisión (autores, objetivos, PICO, variables de resultado, búsquedas,…). El objetivo de este registro es reducir el riesgo de sesgo y reducir la duplicidad.

MyStudies – app

James McCormack, profesor de farmacología del la Universidad de Colombia (el de las canciones versionadas) y Pascal Pfiffner (co-creador de MedCalc) han creado y lanzado en beta https://mystudies.org una aplicación que ayuda a los clínicos a conocer y consultar los ensayos clínicos más importantes.

De momento contiene 249 artículos, aunque sólo permiten acceso a unos pocos de modo gratuito, para acceder a los datos completos de los demás es necesaria la suscripción. Todos ellos tratan sobre riesgo cardiovascular, pero tienen intención de ir ampliándola a otros ámbitos.

Lo que hacen: eligen los estudios más importantes, los valoran y extraen los datos más importantes del método, la intervención el número de participantes, etc. para calcular la magnitud de los resultados en valores absolutos, NNT con sus intervalos de confianza (95% ó 99%).

Puedes localizar los artículos mediante etiquetas o por la referencia o por el nombre del estudio.
!Merece la pena echar un vistazo!

Búsqueda en CENTRAL

Cochrane Central Register of Controlled Trials (CENTRAL) es una de las bases de datos de la Cochrane Library; el mayor repositorio de ensayos clínicos disponible, con aproximadamente 850.000 registros, sin restricción idiomática ni de fecha. Se registran ensayos clínicos identificados en Medline, Embase, en la búsqueda manual de 2400 revistas y de otras fuentes publicadas y no publicadas. De cada ensayo clínico incluido se describen sus datos bibliográficos (autores, publicación, año,…) y en la mayoría de los casos un resumen del ensayo, pero no el texto completo.

La consulta a CENTRAL se realiza a través del buscador de la biblioteca Cochrane, http://onlinelibrary.wiley.com/cochranelibrary/search , utilizando el “Search Limits” antes de añadir la estrategia de búsqueda o el filtro “Trials” una vez ejecutada la búsqueda inicial.

Utilizando el “Search limits”

Utilizando el filtrol “Trials”
Para más información:

Búsqueda de estudios para RS Cochrane: http://training.cochrane.org/sites/training.cochrane.org/files/uploads/satms/public/spanish/Busqueda_de_estudios_aud/story.html